Ebola RNA Persistence w nasieniu przetrwałych wirusów wirusa Ebola – raport końcowy czesc 4

Po włączeniu do badania uczestnicy zostali poproszeni o dostarczenie próbki nasienia w prywatnym pokoju i otrzymali instrukcje zapewniające przestrzeganie właściwych procedur kontroli zakażeń. Wyszkoleni doradcy zaoferowali również uczestnikom dobrowolny, poufny szybki test na ludzki wirus upośledzenia odporności (HIV) zgodnie z krajowym algorytmem testowym. Jednak ten artykuł skupia się wyłącznie na testowaniu nasienia. Próbki z nasienia były przechowywane w lodówce (w temperaturze od 5 do 8 ° C) nie dłużej niż przez 3 dni. Próbki nasienia uzyskane od uczestników fazy zostały przetransportowane i przetestowane w laboratorium terenowym CDC w rejonie Bo, w Sierra Leone, a próbki nasienia uzyskane od uczestników fazy 2 zostały przetransportowane i przetestowane w China CDC Jui Laboratorium w Freetown.
W fazie przeprowadzono ilościowe testy RT-PCR ukierunkowane na docelowe geny EBOV NP i VP40 oraz ludzki gen .2-mikroglobuliny (B2M) (Thermo Fisher Scientific), jak opisano wcześniej.19-21 Próbkę uznano za pozytywną, jeśli cele genowe NP i VP40 wykryto w 40 cyklach replikacji, a wyniki uznano za nieokreślone, jeśli wykryto jeden z celów genów NP lub VP40, ale nie oba.
W fazie 2 zastosowano dwukanałowy, ilościowy zestaw do detekcji RT-PCR do wykrywania genów EBOV NP i GP22 i B2M. Próbkę uznano za pozytywną, jeśli jeden lub oba cele genowe NP lub GP zostały wykryte w 38 cyklach replikacji. Nie było żadnego nieokreślonego wyniku. W przypadku próbek nasienia zarówno w fazie 1, jak i fazie 2, próbkę uznano za negatywną, jeśli oba cele genu EBOV nie zostały wykryte, a wyniki dotyczące statusu B2M były pozytywne. Amplifikacja B2M służyła jako kontrola ekstrakcji i kontrola jakości RNA.
Wartość progowa cyklu dla każdego celu genu jest podawana jako liczba cykli replikacji, które wystąpiły, gdy cel został po raz pierwszy wykryty. Wartości progowe cyklu mają odwrotne powiązanie z ilością RNA, tak że niższe wartości progowe cyklu wskazują większe ilości RNA w danych próbkach.
Analiza statystyczna
W celu analizy trwałości EBOV w spermie, dane wyjściowe z fazy i fazy 2 zebrano w jedną próbkę 220 mężczyzn, którzy przeżyli EVD. Przedstawiona tutaj analiza opisowa koncentruje się na dwóch aspektach: danych socjodemograficznych wszystkich uczestników, według miejsca pochodzenia (z Freetown, obszaru miejskiego oraz z Lungi, obszaru półmiejskiego); oraz liczbę uczestników, którzy mieli dodatni, nieokreślony lub ujemny wynik na ilościowej RT-PCR przy zapisywaniu, zgodnie z liczbą dni pomiędzy datą wypisu z jednostki leczącej ebolę a datą otrzymania próbki nasienia. Kiedy okres między rozładowaniem a datą pobrania próbki był podawany w miesiącach, zastosowano 30-dniową przerwę w miesiącu. Podajemy średnie wartości progowe cyklu, w zależności od miesięcy po wypisaniu, z zakresem (minimalnym i maksymalnym) wartości obserwowanych dla celów genów NP i VP40 (faza 1) oraz dla celów genów NP i GP (faza 2 ). W przypadku innych zmiennych ilościowych podaje się średnie z odchyleniami standardowymi i medianami o zakresie międzykwartylowym
[hasła pokrewne: endometrioza leczenie, cyklofosfamid, wagi apteczne ]

Powiązane tematy z artykułem: cyklofosfamid endometrioza leczenie wagi apteczne